Genetyka
Grzegorz Mendel to czeski zakonnik, który przez 10 lat prowadził badania dotyczące dziedziczenia cech u rozmnażającego się płciowo grochu jadalnego. Swoje wyniki Mendel opublikował w 1866 r. Podał podstawowe zasady dziedziczenia, które stały się podwaliną genetyki doświadczalnej, niestety, dopiero kilkanaście lat później.Doświadczenia Grzegorza Mendla polegały na kojarzeniu (krzyżowaniu) różnych odmian grochu oraz kontrolowaniu, obserwowaniu i notowaniu tych cech rodziców, które występują u potomstwa. Prowadząc wieloletnie obserwacje Mendel zauważył pewną prawidłowość w uzyskanych wynikach. Jego wnioski są obecnie podstawą teorii dziedziczności.
W swoim doświadczeniu wykorzystywał Mendel osobniki z tzw. linii czystej, które otrzymywał po krzyżowaniu między sobą roślin tej samej odmiany. Następnie sprawdzał, czy wybrane cechy występują u wszystkich osobników potomnych. Ogółem Mendel przebadał 7 różnych cech: barwę nasion, długość pędu, kształt nasion, barwę kwiatu, kształt strąka, kolor strąka, położenie kwiatu. Ustalał, które cechy są dominujące (ujawniają się u wszystkich osobników w pierwszym pokoleniu), a które recesywne (występują w drugim pokoleniu u 25% potomstwa). Mendel stwierdził, że wśród siedmiu zbadanych przez niego przeciwstawnych (allelicznych) par cech jedna cecha była zawsze dominująca, a druga recesywna.
Pierwsze prawo Mendla.
Nazywane jest prawem czystości gamet oraz segregacji. Prawo to zakłada że:
Każda cecha dziedziczna jest określona przez jednostki dziedziczności (tę nazwę wprowadził Mendel, dzisiaj nazywane są genami) występujące parami.
Jeśli obydwa geny określające daną cechę są identyczne, wówczas organizm taki nazywamy homozygotą.
Jeśli geny określające daną cechę są różne, wówczas taki organizm nazywamy heterozygotą (mieszańcem). Przeciwstawne formy tego samego genu nazywane są allelami. Sformułowanie Mendla można zilustrować za pomocą wygodnego, powszechnie stosownego systemu znaczeń literowych. W zapisie dużą literą oznaczamy gen dominujący, a taką samą literą tylko małą odpowiadający mu gen recesywny.
Zapis symboliczny osobnika homozygotycznego
AA – homozygota dominujÄ…ca
aa – homozygota recesywna
Zapis symboliczny osobnika heterozygotycznego
Aa – heterozygota
W czasie tworzenia się gamet każda para genów podlega segregacji (rozdzieleniu) w taki sposób, że każda gameta otrzymuje tylko jeden gen z danej pary (I prawo Mendla). To oznacza, że gameta zawiera jeden rodzaj genu warunkującego daną cechę.
Pierwsze prawo odnosi się do dziedziczenia jednej cechy i można je przedstawić graficznie (przy pomocy krzyżówki).
Krzyżówka – czerwono kwitnÄ…cego grochu z grochem kwitnÄ…cym biaÅ‚o – nazywana krzyżówkÄ… – typ pisum (dominacji zupeÅ‚nej).
Dane:
A– oznacza gen zapisujÄ…cy barwÄ™ czerwonÄ…,
a– oznacza gen zapisujÄ…cy barwÄ™ białą,
P– pokolenie rodziców,
F1, F2 – kolejne pokolenia
Skrzyżowano osobnika o czerwonych kwiatach z osobnikiem o białych kwiatach
P AA x aa
Gamety A, A, a, a
F1 Aa Aa Aa Aa
Można ustalić cechy poszczególnych roślin:
Fenotyp, czyli zewnętrzny wygląd osobnika będący efektem współdziałania jego genów i warunków środowiska.
W uzyskanym pokoleniu F1 wszystkie osobniki będą miały czerwone kwiaty (Aa).
Genotyp to zespół genów danego osobnika. W otrzymanym pokoleniu F1 wszystkie osobniki będą heterozygotami.
W kolejnym pokoleniu po skrzyżowaniu osobników z pokolenia F1 otrzymamy.
Aa x Aa
F2 AA Aa Aa aa
czyli
fenotyp będzie 3:1 (3 czerwone i 1 biały)
genotyp będzie 2:2 (2 homozygoty /AA, aa/, 2 heterozygoty /Aa/).
Aby stwierdzić, czy osobniki wykorzystywane do doÅ›wiadczenia (krzyżówki) sÄ… homozygotami dominujÄ…cymi czy heterozygotami (fenotyp bÄ™dzie identyczny) przeprowadzić należy krzyżówkÄ™ testowÄ… – polegajÄ…cÄ… na skrzyżowaniu osobnika z homozygotÄ… recesywnÄ…. JeÅ›li badana roÅ›lina byÅ‚a homozygotÄ… dominujÄ…cÄ… wówczas wszystkie roÅ›liny w F1 bÄ™dÄ… kwitÅ‚y na czerwono. Natomiast jeÅ›li poÅ‚owa roÅ›lin F1 bÄ™dzie miaÅ‚a biaÅ‚e kwiaty to badana roÅ›lina byÅ‚a heterozygotÄ…. RozkÅ‚ad fenotypów w krzyżówce testowej wynosi 2:2.
W wieloletnich pracach, zwłaszcza przy zmianie obiektów doświadczenia, Mendel zauważał inne sposoby przekazywania i ujawniania się cech u osobników potomnych. Z taką innością spotkał się Mendel, kiedy skrzyżował rośliny dziwaczka o kwiatach białych i czerwonych. Okazało się, że w pierwszym pokoleniu powstała fenotypowa cecha będąca połączeniem cech rodziców. U tych roślin allel determinujący barwę kwiatów wykazuje niepełną dominację, czyli allele kodują odmienne cechy, lecz żaden z nich nie dominuje nad drugim (współdominowanie).
Powstanie cechy pośredniej można wytłumaczyć zbyt małą ilością wyprodukowanego barwnika (przy obecności jednego allelu dominującego), który nie wystarcza do pełnego zabarwienia kwiatów tworząc fenotyp pośredni.
Krzyżówka z niepeÅ‚nÄ… dominacjÄ… – typ zea
P AA x aa (białe)
F1 Aa x Aa (różowe)
Aa x Aa (różowe)
F2 AA Aa Aa aa
czerwone różowe różowe białe
stosunek fenotypów wynosi 1 : 2 : 1
Genotyp – jeÅ›li allele wykazujÄ… niepeÅ‚nÄ… dominacjÄ™ trudno powiedzieć, który z alleli można uznać za dominujÄ…cy.
Drugie prawo Mendla
Dotyczy krzyżówek, w których rodzice różnią się większą liczbą niezależnych cech.
Każda para genów podlega losowej segregacji i jest dziedziczona niezależnie od genów innych.
Obecnie wiadomo, że prawo niezależnej segregacji sprawdza się tylko wtedy, gdy każda para genów znajduje się na innej parze homologicznych chromosomów. Gdy są na jednym chromosomie, będą przekazywane razem, ponieważ to chromosomy ulegają niezależnej segregacji, a nie geny jak uważał Mendel.
Krzyżówka przedstawiająca drugie prawo Mendla
Mendel przeprowadził doświadczenie, w którym badał 2 cechy morfologiczne, za które odpowiedzialne są różne geny dziedziczące się niezależnie od siebie.
Obserwował barwę i pokrycie nasion grochu.
Dane:
A, a – barwa nasiona (A-żółte; a-zielone)
B, b – ksztaÅ‚t nasion (B-gÅ‚adkie; b-pomarszczone)
Skrzyżował rośliny o żółtych, gładkich nasionach z zielonymi, pomarszczonymi.
P AABB x aabb
F1 Aa Bb Aa Bb Aa Bb Aa Bb
W pokoleniu F1
fenotypy byÅ‚y 4:0 – wszystkie potomne roÅ›liny wytwarzaÅ‚y żółte gÅ‚adkie nasiona
genotypy – wszystkie osobniki byÅ‚y heterozygotami
Aa Bb x Aa Bb
Wynik losowego połączenia się wszystkich gamet może przedstawić pod postacią szachownicy Punneta:
F2
Gamety
AB
Ab
aB
ab
AB
ABAB
AbAB
aBAB
abAB
Ab
ABAb
AbAb
aBAb
abAb
aB
ABaB
AbaB
aBaB
abaB
ab
ABab
Abab
aBab
abab
Genotyp – 2 homo : 14 hetero
Fenotyp:
9 roślin o żółtych gładkich nasionach
3 rośliny o żółtych pomarszczonych
3 rośliny o zielonych gładkich
1 roślina o zielonych pomarszczonych
Odstępstwa od praw Mendla
Allele wielokrotne
Zgodnie z I prawem Mendla istnieją dwa allele tego samego genu. Okazało się, że jest to prawdziwe dla jednego osobnika. Są przypadki, że w całej populacji może występować więcej odmian tego samego genu. Są to allele wielokrotne. Oznacza to występowanie w populacji wielu alleli danej cechy. Jest to prawdopodobnie efektem mutacji i przyczynia się do wzrostu zmienności cech w obrębie populacji.
Przykładem alleli wielokrotnych są grupy krwi w populacji człowieka. Wyróżniamy grupy A, B, AB, O.
Osobnik posiadający określoną grupę krwi może być homo lub heterozygotą.
Grupa krwi A
IA IA zapis dla homozygoty
IA i zapis dla heterozygoty
Grupa krwi B
IB IB zapis dla homozygoty
IB i zapis dla heterozygoty
Grupa krwi AB
IA IB zapis tylko jeden
Grupa krwi O
i i zapis tylko jeden
Plejotropizm. Według Mendla każdy gen warunkował jedną cechę organizmu. Dzięki późniejszym badaniom, udowodniono istnienie sytuacji, że jeden gen może wpływać na różne cechy organizmu. Nazwano to zjawisko plejotropowym działaniem genu. W trakcie przeprowadzanego doświadczenia na roślinach stwierdzono, że gen A wpływa na barwę płatków oraz pojawiające się plamy na łodydze.
Współdziałanie genów
Istnieje sytuacja, że ujawnienie się jednej cechy zależy od wielu genów. Doświadczalnie udowodnili takie dziedziczenie Bateson i Punnet.
Skrzyżowali oni biało kwitnący groszek pachnący ze sobą. W pokoleniu F1 otrzymali wszystkie potomne rośliny o kwiatach czerwonych. W pokoleniu F2 rozkład cech fenotypowych wynosił 9:7. Okazało się, że czerwona barwa kwiatów wywołana jest barwnikiem antocyjanem, którego powstawanie zapisują geny dominujące A, B. Osobniki, u których jeden z genów jest recesywny, mają kwiaty białe,
czyli P aa BB x AAbb
kwiat biały kwiat biały
F1 AaBb, AaBb – wszystkie kwiaty bÄ™dÄ… czerwone.
Dzisiaj wiadomo, że do cech zapisanych przez wiele genów należą u człowieka: wzrost, kształt ciała, barwa skóry, inteligencja.
Geny uzupełniające się.
Istnieją geny hipostazy oraz epistazy. Te pojęcia (epistaza, hipostaza) odnoszą się do genów, które nie są allelami. Obecność dominującego genu epistazy umożliwia ujawnienie cech zapisanych w genach hipostazy.
Geny supresorowe
Są to geny, które swoją obecnością powodują znoszenie efektów fenotypowych innych genów.
Geny letalne
Są to najczęściej geny recesywne, których obecność prowadzi do śmierci organizmu. Powodują one umieranie organizmu już w okresie rozwoju zarodkowego.
Chromosomowa teoria dziedziczności
TwórcÄ… chromosomowej teorii dziedzicznoÅ›ci jest Thomas Morgan (żyjÄ…cy w latach 1866-1945, amerykaÅ„ski genetyk), który badaÅ‚ dziedziczenie różnych cech (np. ksztaÅ‚t i wielkość skrzydeÅ‚, barwÄ™ oczu u muszki owocowej – Drosophila melanogaster). Muszka okazaÅ‚a siÄ™ doskonaÅ‚ym obiektem badaÅ„, ponieważ;
zawiera mało chromosomów (tylko 4 pary)
chromosomy jej są duże, łatwo je obserwować pod mikroskopem optycznym
charakteryzuje się dużą zmiennością
charakteryzuje się dużą rozrodczością
w ciągu roku można uzyskać kilka pokoleń muszek, ponieważ mają krótki cykl rozwojowy trwający tylko 14 dni.
Morgan w 1910-11 roku opublikował swoje wnioski dotyczące prowadzonych obserwacji dziedziczenia cech u muszki owocowej. Morgan wykazał, że:
czynnikami dziedziczenia są geny umieszczone w chromosomie (widoczne jako ciemniejsze i jaśniejsze prążki po odpowiednim wybarwieniu)
geny ułożone są w chromosomie liniowo, każdy gen ma swoje ustalone miejsce, nazywane locus,
geny (allele) zapisujące określoną cechę występują w tych samych miejscach w chromosomach homologicznych,
w czasie podziaÅ‚u mejotycznego (przy tworzeniu gamet) zachodzi wymiana odcinków miÄ™dzy chromosomami homologicznymi – zjawisko crossing-over,
geny występujące w jednym chromosomie dziedziczą się razem, odstępstwem od tej reguły jest crossing-over, w wyniku którego geny występujące zawsze razem czasem mogą występować oddzielnie,
dwa geny dziedziczą się niezależnie, jeśli ułożone są na innych chromosomach,
geny ułożone blisko siebie w chromosomie dziedziczą się zawsze razem i nazywane są genami sprzężonymi. Tym więcej genów sprzężonych, im więcej krótkich chromosomów w komórce. Morgan sporządził listę cech sprzężonych u muszki. Wyliczył, że liczba sprzężeń równa się pojedynczej liczbie chromosomów. Geny ułożone daleko od siebie, ale w jednym chromosomie częściej ulegają crossing-over. Morgan sporządził mapy chromosomów u muszki. Miarą odległości genów na chromosomie jest częstotliwość występowania crossing-over.
Dziedziczenie płci
Płeć determinowana jest przez chromosomy płci. U kobiet występują 2 identyczne chromosomy płci są to XX, a u mężczyzn występuje chromosom X oraz chromosom Y. Kobieta posiada 22 autosomy + XX (chromosomy płci), a mężczyzna posiada 22 autosomy + XY (chromosomy płci). U człowieka w chromosomie X występuje wiele genów zapisujących cechy potrzebne do życia osobom obu płci. Cechy zapisane w tym chromosomie nazywamy cechami sprzężonymi z płcią (są to np. hemofilia, daltonizm). W chromosomie Y jest tylko kilka genów. Określa się ten chromosom jako genetycznie pusty, jego obecność jest związana z cechami męskości.
Przekazywanie chromosomów płci odbywa się wg zasady:
dziewczynka otrzymuje jeden chromosom X od matki, drugi chromosom X ulega genetycznej inaktywacji tworząc ciałko Barra (stan heterochromatyny). Jest sprawą przypadku, który z chromosomów X (od matki czy od ojca) ulegnie inaktywacji. Chromosom X, który osiągnie stan heterochromatyny pozostaje genetycznie nieczynny we wszystkich komórkach.
chłopiec otrzymuje od ojca chromosom Y, a od matki chromosom X.
Liczba aktywnych chromosomów X jest taka sama u kobiet i mężczyzn.
Mechanizm determinacji płci przyjmuje różne warianty w świecie zwierząt, np. u ptaków, motyli płeć samicy warunkuje genotyp XY, a samca XX.
Budowa i rola kwasów nukleinowych
Kwasy nukleinowe to dÅ‚ugie nici polinukleotydowe, zbudowane z nukleotydów, do zapisu których używa siÄ™ jednoliterowych skrótów oznaczajÄ…cych odpowiednie zasady azotowe (skÅ‚adnik różniÄ…cy nukleotydy): A – adenina, G – guanina, C – cytozyna, T– tymina, U – uracyl.
Wyróżnia się kilka funkcjonalnych kwasów nukleinowych (kwasy nukleinowe):
DNA – kwas deoksyrybonukleinowy. CzÄ…steczki tego kwasu mogÄ… być koliste (u bakterii) lub pofaÅ‚dowane i ciasno upakowane (u roÅ›lin, zwierzÄ…t, czÅ‚owieka). DNA peÅ‚ni funkcjÄ™ materiaÅ‚u genetycznego. Zawarta jest w nim informacja o wszystkich biaÅ‚kach komórki oraz o wszystkich zachodzÄ…cych w komórce procesach. Informacja ta jest powielana (replikacja) i przekazywana komórkom potomnym.
RNA – kwas rybonukleinowy. WystÄ™puje w wiÄ™kszych iloÅ›ciach w komórce niż DNA. Tworzy pojedyncze nici polinukleotydowe, w wielorakich formach molekularnych:
tRNA – transportujÄ…cy RNA – ma charakterystycznÄ… budowÄ™, odpowiada za przeniesienie aminokwasów do rybosomów w czasie syntezy biaÅ‚ka. Istnieje 60 rodzajów tRNA.
mRNA – informacyjny RNA – ma dużą rozpiÄ™tość masy czÄ…steczkowej w zależnoÅ›ci od wielkoÅ›ci powstajÄ…cego biaÅ‚ka. Jego rolÄ… jest przenoszenie informacji o skÅ‚adzie aminokwasowym biaÅ‚ka. IstniejÄ… tysiÄ…ce rodzajów mRNA (tyle, ile jest różnych biaÅ‚ek w organizmie).
rRNA – rybosomowy RNA – nie wystÄ™puje w stanie wolnym, lecz wchodzi w skÅ‚ad rybosomów. IstniejÄ… 3-4 rodzaje rRNA.
Cechy kodu genetycznego
Informacja genetyczna konieczna do utworzenia konkretnego biaÅ‚ka zawarta jest w jÄ…drze komórkowym w kwasie DNA. Informacja, nazywana kodem genetycznym, jest przepisana w procesie transkrypcji na mRNA. Proces ten przebiega w jÄ…drze komórkowym w czasie transkrypcji. Część podwójnej helisy DNA rozdziela siÄ™ czasowo na dwie nici. Na jednej z nich syntetyzowana jest komplementarnie nić mRNA (od koÅ„ca 5’ do 3’) w obecnoÅ›ci enzymu polimerazy RNA oraz czynników inicjujÄ…cych. Do syntezy każdego z tysiÄ™cy powstajÄ…cych w organizmie biaÅ‚ek potrzebny jest inny specyficzny mRNA. Później przepisana informacja wykorzystywana jest w procesie translacji do ukÅ‚adania odpowiednich aminokwasów w biaÅ‚ko.
Kod genetyczny jest:
Trójkowy, czyli trzy kolejne nukleotydy, tzw. kodony (triplety), zawarte w kwasie nukleinowym wyznaczają określony aminokwas w białku.
Znanych jest 20 rodzajów aminokwasów występujących w białkach. W DNA są tylko 4 różne nukleotydy, przy pomocy których zapisana jest informacja genetyczna. Jeśli jeden aminokwas byłby zaszyfrowany w kodzie za pomocą jednego nukleotydu, to informacja ta zapisywałaby tylko 4 aminokwasy.
JeÅ›li dwa kolejne nukleotydy zapisywaÅ‚yby jeden aminokwas to istniaÅ‚oby 16 możliwych kombinacji, czyli 4 aminokwasy byÅ‚yby nie zapisane. Ustalono, że do zapisania jednego aminokwasu potrzeba trzech kolejnych nukleotydów. PowstajÄ… wówczas 64 możliwe kombinacje 43 =64; można zapisać 20 aminokwasów i zostaje duży “zapas” trójek. WÅ›ród 64 trójek kodujÄ…cych sÄ… trzy tryplety: UAA, UAG, UGA, które nie kodujÄ… aminokwasów, peÅ‚niÄ… funkcjÄ™ kropek (nazywane sÄ… terminatorami lub trójkami nonsensowymi).
Niejednoznaczny – trójek kodujÄ…cych 20 aminokwasów jest 61; niektóre trójki sÄ… synonimami oznaczajÄ…cymi ten sam aminokwas. Oznacza to, że aminokwas może być wyznaczony (zapisany) przez wiÄ™cej niż 1 kodon (nawet do 6 zapisów, np. leucyna). Najczęściej kodony wyznaczajÄ…ce ten sam aminokwas majÄ… dwie pierwsze zasady takie same, a różniÄ… siÄ™ jedynie trzeciÄ… zasadÄ….
Bezprzecinkowy, kod nie posiada specjalnych oznaczeń odgraniczających jeden kodon od drugiego. Koniec zapisu danego białka zapisuje trójka nonsensowna (terminator): UAA, UAG lub UGA, której nie odpowiada żaden aminokwas.
Niezachodzący, czyli trójki odczytywane są kolejno, jedna nie zachodzi na drugą.
Uniwersalny: u różnych organizmów ten sam kodon oznacza ten sam aminokwas.
Biosynteza białka
Proces biosyntezy biaÅ‚ka rozpoczyna siÄ™ od transkrypcji, czyli przepisania informacji o skÅ‚adzie aminokwasów. TranskrypcjÄ™ rozpoczyna polimeraza RNA, która wÄ™druje do miejsca w DNA zwanego promotorem. Jest to proces wymagajÄ…cy nakÅ‚adu energii, przyłączenie jednego nukleotydu wymaga dwóch wiÄ…zaÅ„ zwiÄ…zku wysokoenergetycznego. W komórkach eukariotycznych w procesie transkrypcji powstaje poczÄ…tkowo pre-mRNA, tzw. prekursorowy RNA, zawierajÄ…cy odcinki kodujÄ…ce – eksony oraz niekodujÄ…ce – introny. Po wyciÄ™ciu intronów i połączeniu eksonów powstaje mRNA, który przechodzi do cytoplazmy i łączy siÄ™ z rybosomami. PowstaÅ‚a nić mRNA w komórkach eukariotycznych zbudowana jest z 4 charakterystycznych odcinków: poczÄ…tek od koÅ„ca 5’ to czapeczka zbudowana z 7-metylo Gppp, obejmujÄ…ca dwa nukleotydy, drugi odcinek nazywany jest liderem, obejmuje ok. 80 nukleotydów, trzeci odcinek zawiera zapis Å‚aÅ„cucha biaÅ‚kowego, czwarty odcinek zawiera terminator oraz ok. 200 reszt kwasu adenylowego.
Proces syntezy biaÅ‚ka poprzedza aktywacja aminokwasów zachodzÄ…ca na terenie cytoplazmy. Aktywacja polega na wzbogaceniu energetycznym aminokwasu (AA) w obecnoÅ›ci ATP i enzymu. Zaktywowany aminokwas łączy siÄ™ z odpowiadajÄ…cym mu (zapis w antykodonie) specyficznym tRNA (do koÅ„ca 3’). Powstaje aminoacylo-tRNA oraz AMP.
tRNA zawiera specyficzny punkt rozpoznający, tzw. antykodon, zbudowany z trzech nukleotydów (tryplet) o specyficznej sekwencji, różnej dla różnych aminokwasów. Antykodon jest komplementarny w stosunku do odpowiedniego kodonu na mRNA. Antykodon pozwala umiejscowić aminokwas we właściwej pozycji na nici mRNA w rybosomie.
Właściwy proces syntezy białka nazywamy translacją.
Inicjacja rozpoczyna proces biosyntezy od połączenia mniejszej podjednostki rybosomu z mRNA od koÅ„ca 5’, gdzie znajduje siÄ™ kodon odpowiadajÄ…cy metioninie. Do tego kodonu komplementarnie przyłącza siÄ™ zaktywowany kompleks aminoacylo-tRNA, zawierajÄ…cy metioninÄ™ (metionylo-tRNA u eukariota, a formylometionylo-tRNA u prokariota).
W chwili tego łączenia nastÄ™puje przyłączenie dużej podjednostki rybosomu do maÅ‚ej, a w rowku miÄ™dzy nimi ukÅ‚ada siÄ™ mRNA. W powstaÅ‚ym rybosomie znajdujÄ… siÄ™ dwa charakterystyczne miejsca: miejsce A, aminokwasowe oraz miejsce P, peptydowe. PeÅ‚niÄ… one okreÅ›lone role w czasie syntezy biaÅ‚ka. Miejsce P – łączy siÄ™ z pierwszym kompleksem aminokwasowym przynoszonym najpierw do miejsca A. W miejscu aminokwasowym nastÄ™puje odczytanie kodonu przez kolejne antykodony, rozpoczyna siÄ™ tworzenie wiÄ…zania peptydowego. Tak przygotowany rybosom oraz zainicjowana synteza rozpoczyna kolejny etap biosyntezy, tzw. elongacjÄ™. Rozpoczyna siÄ™ ona od opuszczenia miejsca P przez zdeaminoacylowany tRNA. Zwolnione miejsce jest “zajmowane” przez aminokwas obecny w miejscu A. Miejsce A staje siÄ™ wolne i może wiÄ…zać nastÄ™pnÄ… czÄ…steczkÄ™ aminokwas-tRNA, caÅ‚y cykl powtarza siÄ™ tak dÅ‚ugo aż powstanie caÅ‚e biaÅ‚ko.
Ostatni etap, tzw. terminacja, następuje wówczas, gdy w miejscu A pojawia się nonsensowna trójka kodująca (terminator), informująca o końcu białka. Wówczas rybosomy rozpadają się na podjednostki, a powstałe białko (ma strukturę pierwszorzędową) przechodzi do ER (siateczka śródplazmatyczna), gdzie, przybierając kolejne rzędowości, przygotowuje się do funkcji, jaką będzie pełniło. Cały proces syntezy zachodzi bardzo szybko. Obliczono, że łączenie 360 aminokwasów trwa około 18 sekund.
Regulacja ekspresji genetycznej
Organizm nie syntetyzuje przez caÅ‚y czas wszystkich biaÅ‚ek. ByÅ‚oby to niekorzystne, ponieważ część biaÅ‚ek byÅ‚aby niepotrzebna i organizm musiaÅ‚by je wydalać, co powodowaÅ‚oby olbrzymie straty energii i “surowców”. Liczne geny sÄ… nieczynne, a funkcjonujÄ… tylko potrzebne w danej chwili. Proces regulacji tworzenia biaÅ‚ek nazywamy ekspresjÄ… genetycznÄ…, czyli ujawnianiem siÄ™ cechy warunkowej okreÅ›lonym genem.
Przedstawili ten proces w 1961 roku Jacob i Monod jako tzw. teorię operonu laktozowego. Poznali oni mechanizm regulacji dodatniego i ujemnego działania genu u bakterii okrężnicy (Escherichia coli) w tzw. systemie indukcyjnym. Stwierdzili, że w chromosomie występuje jednostka funkcjonalna nazywana operonem będąca zespołem genów strukturalnych i regulatorowych. Geny strukturalne odpowiedzialne są za syntezę enzymów (białek), a geny regulatorowe kontrolują i regulują pracę genów strukturalnych.
Do genów regulatorowych zaliczamy:
Gen regulator (R) – odpowiedzialny za syntezÄ™ biaÅ‚ka nazywanego represorem.
Gen operator (O) – kontroluje pracÄ™ genów strukturalnych umożliwiajÄ…c lub blokujÄ…c proces transkrypcji.
W regulacji ekspresji genetycznej istnieją dwa typy regulacji działania genu.
Pierwszy nazywany dodatnim, umożliwia proces transkrypcji oraz syntezÄ™ biaÅ‚ka. Bakterie okrężnicy hodowane sÄ… na pożywce, w której znajduje siÄ™ laktoza. W ich komórkach gen regulator (R) wytwarza aktywne biaÅ‚ko zwane represorem, które łączy siÄ™ z obecnym w pożywce induktorem – laktozÄ…, powodujÄ…c jego inaktywacjÄ™. Operator nie jest zablokowany, rozpoczyna siÄ™ proces transkrypcji mRNA oraz synteza potrzebnych enzymów do rozkÅ‚adu laktozy.
Drugi typ regulacji ujemny wystÄ™puje wówczas, gdy w pożywce zabraknie laktozy, wówczas gen regulator (R) wytwarza aktywne biaÅ‚ko – represor (ponieważ w podÅ‚ożu nie ma induktora, którym jest laktoza), który łączy siÄ™ z poeratorem, blokujÄ…c proces transkrypcji. Enzymy nie sÄ… produkowane.
Proces regulacji genów u eukariota jest bardzo złożony, nie jest jeszcze wyjaśniony. Uczestniczą w tej regulacji hormony białkowe i sterydowe.
Zmienność organizmów
Zmienność oznacza szereg procesów prowadzących do wytworzenia różnic między osobnikami danej populacji lub między populacjami. Zmienność może wywoływać: środowisko, mutacje, rekombinacje genów. Zmienność może być dziedziczna i niedziedziczna.
Zmienność środowiskowa
Zmienność środowiskowa nazywana jest fluktuacyjną lub modyfikacyjną. Nie jest dziedziczna. Wpływa na fenotyp (wygląd) osobnika. Ta zmienność jest wypadkową pomiędzy warunkami, jakie stwarza genotyp (zespół genów) a warunkami środowiska. Jednak istnieje tzw. plastyczność genotypu, czyli określona granica zmian wartości danej cechy. Przykładem takiej zmienności jest zróżnicowany pokrój sosny rosnącej w różnych siedliskach.
Sosna rosnąca na polanie jest niewysokim drzewem, o równomiernie rozwiniętych konarach.
Sosna rosnąca w środku lasu jest bardzo wysokim drzewem, z rozwiniętymi szczytowymi częściami pędu, a suchymi dolnymi.
Sosna rosnÄ…ca na wydmie jest niskim drzewem posiadajÄ…cym powyginane konary zgodnie z kierunkiem wiejÄ…cego wiatru.
Wszystkie sosny posiadają cechy charakterystyczne dla gatunku. Są drzewami pokrytymi szaro-brązową, spękaną korą. Liście mają w formie igieł osadzone po dwie na krótkopędzie. Kwiatostanem żeńskim jest owalna szyszka. Wytwarzają nasiona, z których w zależności od miejsca wykiełkowania wyrośnie fenotypowo zmieniona sosna.
Zmienność rekombinacyjna
Jest zmiennością dziedziczną. Polega na mieszaniu materiału genetycznego w procesach rekombinacji, dzięki którym powstają nowe układy genów, czyli nowe genotypy. W wyniku tej zmienności osobniki rozmnażające się płciowo różnią się pod względem posiadanych genów, każdy osobnik jest odmienny genetycznie (wyjątek stanowią bliźniaki jednojajowe). Odmienność genetyczna wynika z tworzenia nowych układów z już istniejących genów, nie powstają nowe geny.
Do rekombinacji genów dochodzi:
W czasie procesu crossing-over, zachodzącego w pierwszym podziale mejotycznym. Proces ten polega na wymianie odcinków dotyczących określonej cechy w chromosomach homologicznych.
Przy losowym rozchodzeniu się chromosomów do gamet w czasie mejozy.
Przy losowym łączeniu się gamet w czasie zapładniania.
Zmienność rekombinacyjna, ponieważ jest dziedziczna, odgrywa podstawową rolę w procesie ewolucji oraz w hodowli zwierząt i roślin (stosowanie selekcji).
Zmienność mutacyjna
W wyniku zmienności mutacyjnej powstają allele genów. Zmienność nazywana mutacją, powstaje nagle powodując dziedziczne zmiany w genotypie. Mutacje wywoływane są czynnikami mutagennymi, do których należą: promienie Roentgena, promienie nadfioletowe, kwasy azotowe, analogi zasad, barwniki akrydynowe. Mutacja może dotyczyć pojedynczego genu, zmiany struktury chromosomu, zmiany liczby chromosomów.
Mutacja punktowa – dotyczy zmiany pojedynczego genu, prowadzi do powstawania nowych alleli powodujÄ…cych zmianÄ™ sensu zapisu oraz zmianÄ™ fazy odczytu (sÄ… włączone niewÅ‚aÅ›ciwe aminokwasy do biaÅ‚ka).
Przykładami mutacji punktowych są:
Tranzycja – polega na zmianie zasady purynowej na innÄ… purynowÄ… (Adenina, guanina) lub pirymidynowej na innÄ… pirymidynowÄ… (cytozyna, tymina).
Transwersja – polega na zmianie zasady purynowej na pirymidynowÄ… lub odwrotnie.
Delecja – polega na wypadniÄ™ciu nukleotydu.
Insercja – polega na wstawieniu nukleotydu.
Skutkami mutacji punktowej jest powstawanie schorzeń genetycznych wynikających z zaburzenia bloków metabolicznych.
Przykładami schorzeń będących skutkiem mutacji punktowej w organizmie człowieka są:
Fenyloketonuria – spowodowana brakiem enzymu przeksztaÅ‚cajÄ…cego fenyloalaninÄ™ w tyrozynÄ™. PowstajÄ… z fenyloalaniny kwasy, które powodujÄ… uszkodzenie ukÅ‚adu nerwowego oraz niedorozwój umysÅ‚owy. Uszkodzeniu ulega recesywny gen. W Polsce bardzo dużo osób jest nosicielami genu fenyloketonurii, chorujÄ… osobniki homozygotyczne.
Alkaptonuria – jest wynikiem uszkodzenia genu recesywnego, w którym zapisana jest informacja o enzymie przeksztaÅ‚cajÄ…cym kwas homogentyzynowy w kwas fumarowy. NieprzeksztaÅ‚cony kwas odkÅ‚ada siÄ™ w stawach, niszczÄ…c je.
Albinizm – wywoÅ‚any jest mutacjÄ… genu recesywnego. Brak w organizmie enzymu tyrozynazy, który odpowiada za wytworzenie melaniny; powoduje to brak zabarwienia skóry, wÅ‚osów oraz tÄ™czówki.
Anemia sierpowata – powstaje z powodu uszkodzenia genu recesywnego odpowiedzialnego za tworzenie włókienek biaÅ‚kowych hemoglobiny. W wyniku mutacji nastÄ™puje zmiana włączonych aminokwasów, powodujÄ…c zmianÄ™ ksztaÅ‚tu erytrocytów.
Mutacje struktury chromosomów, tzw. aberracje.
W wyniku tych mutacji następuje zaburzenie pierwotnej struktury chromosomu. Są wynikiem nieprawidłowego procesu crossing-over. Przykładem tej mutacji są:
deficjencja (delecja) – polegajÄ…ca na utracie odcinka chromosomu.
duplikacja – podwojenie odcinka chromosomu.
inwersja – odwrócenie odcinka chromosomu o 180°.
translokacja – przyłączenie do chromosomu odcinka chromosomu niehomologicznego.
Mutacje liczbowe, tzw. genomowe, powodują zmianę liczby chromosomów.
Prawidłowa liczba chromosomów w komórce diploidalnej wynosi 2n, w haploidalnej 1n. W mutacji genomowej zostaje zaburzona liczba chromosomów. W wyniku tej mutacji mogą powstać:
Aneuploidy, organizmy u których następuje utrata jednego chromosomu 2n-1 (tzw. monosomik), lub mają o jeden chromosom za dużo 2n+1 (tzw. trisomik). Przyczyną tej mutacji jest nondysjunkcja polegająca na niewłaściwym (braku rozejścia) rozejściu się chromosomów w czasie mejozy.
Skutkami mutacji genomowej z nondysjunkcją jest powstanie chorób genetycznych wynikających z zaburzenia prawidłowej liczby chromosomów.
Zespół Downa – tzw. trisomia 21 pary. Objawami sÄ… niedorozwój umysÅ‚owy, niski wzrost, nieprawidÅ‚owe proporcje ciaÅ‚a, zbyt duży jÄ™zyk, wady narzÄ…dów wewnÄ™trznych.
Zespół Edwardsa – trisomia 18 pary chromosomów. Objawami sÄ… głęboki niedorozwój umysÅ‚owy, wady rozwojowe.
Zespół Turnera – jest monosomiÄ… chromosomów pÅ‚ci. WystÄ™puje tylko u kobiet. Objawami sÄ… bezpÅ‚odność, niedorozwój jajników, niski wzrost, krÄ™pa budowa ciaÅ‚a.
Zespół nadkobiety – jest trisomiÄ… chromosomu X. Objawami sÄ… “wzmocnione” cechy kobiece. Niekiedy obniżona inteligencja oraz zaburzenia miesiÄ…czkowania.
Zespół Klinefertera – wystÄ™puje u mężczyzn. Jest trisomiÄ… chromosomu X. Objawami sÄ…: bezpÅ‚odność, niedorozwój jÄ…der, zmienione proporcje ciaÅ‚a, cechy kobiece w wyglÄ…dzie. BywajÄ… anomalie seksualne.
Zespół nadsamca – trisomie chromosomu Y. Mężczyźni charakteryzujÄ… siÄ™ wysokim wzrostem, zwiÄ™kszonÄ… pobudliwoÅ›ciÄ… emocjonalnÄ… i agresywnoÅ›ciÄ…, sÄ… pÅ‚odni.
Poliploidy, czyli euploidy. U tych organizmów zostaje zwielokrotniony cały garnitur chromosomów, np. 3n, 4n, 5n. Mutację tę można wywołać sztucznie (np. kolchicyną), blokując rozejście się chromosomów w czasie podziału komórki.
IstniejÄ…:
autopoliploidy – u których zwielokrotnienie garnituru chromosomów zachodzi w obrÄ™bie jednego gatunku.
allopoliploidy (amfiploidy) – u których zwielokrotnienie garnituru chromosomów zachodzi przy tworzeniu mieszaÅ„ców, np. żubroÅ„, pszenżyto, kuro-indyk. U tych osobników brak chromosomów homologicznych. Nie zachodzi proces mejozy. Nie tworzÄ… gamet.
Skutki mutacji mogą być:
niekorzystne, ponieważ powodują śmierć organizmu, choroby genetyczne, zmniejszają zdolność adaptacyjną organizmu,
neutralne – zwÅ‚aszcza jeÅ›li dotyczÄ… komórek somatycznych,
korzystne – zwiÄ™kszajÄ… możliwoÅ›ci adaptacyjne organizmu.
Mutacje są podstawowym mechanizmem napędowym ewolucji organizmów jako pierwotne źródło zmienności genetycznej. Zmiany powstające w mutacji, podlegają naturalnej selekcji, która faworyzuje nosicieli korzystnych alleli w danym środowisku.
Rola genetyki
Obecnie genetyka jest nauką posiadającą duże możliwości rozwoju (zastosowanie nowoczesnych technologii), przed którą stoją olbrzymie potrzeby (nowe szczepionki, tworzenie leków białkowych, terapia genowa) oraz obawy związane z brakiem znajomości skutków prowadzonych manipulacji genetycznych. Obawy dotyczą również braku przepisów prawnych ograniczających ingerencję człowieka, ze względu na ryzyko naruszenia równowagi biologicznej w przyrodzie.
Obecnie genetyka ma zastosowanie:
W rolnictwie:
zwiększanie plonów,
zwiększanie przeżywalności roślin,
tworzenie roślin wybujałych (poliploidów),
tworzenie nowych odmian odpornych na szkodliwe warunki środowiska,
hodowanie roślin w kierunku pożądanym dla człowieka, np. duże owoce, niskie drzewa, szybko owocujące odmiany.
W hodowli:
prowadzenie krzyżówek rasotwórczych,
hodowle użytkowe,
tworzenie poliploidów zwiększających masę mięsną.
W medycynie:
prowadzenie poradnictwa prenatalnego,
genetyka atakujących człowieka wirusów i bakterii w celu tworzenia szczepionek oraz leków,
produkowanie hormonów (np. insuliny),
stosowanie terapii genowej.
Inżynieria genetyczna
Inżynieria genetyczna określa postępowanie zmierzające do przekształcenia informacji genetycznej poprzez stosowanie technologii. Polega na manipulowaniu materiałem dziedzicznym w celu otrzymania nowych genów, odmian, gatunków. Obecnie inżynieria genetyczna stosuje cały szereg biotechnologii.
Transformacja – polega na przeniesieniu informacji z komórki dawcy do komórki biorcy w postaci wolnego DNA. Informacja pochodzi z nukleoidu bakterii.
Transolukcja – polega na przeniesieniu informacji genetycznej za poÅ›rednictwem bakteriofagów (nazwanych wektorami) z jednej komórki do drugiej.
Rekombinacja – polega na wymianie fragmentów kwasu DNA. UmożliwiajÄ… ten proces nukleazy restrykcyjne (enzymy), które rozpoznajÄ… specyficzne sekwencje w DNA, tworzÄ…c w miejscu wyciÄ™cia tzw. lepkie koÅ„ce, do których wbudowywany jest nowy odcinek DNA przenoszony przy pomocy wektorów (plazmidów, wirusów).
Klonowanie – polega na powieleniu (namnażaniu) identycznych genów, komórek, organizmów, nazywanych klonami.